据路透社报道，百度与赛诺菲达成一项合作协议，百度将优化 mRNA 序列的高效算法 LinearDesign 授权给赛诺菲，用于 mRNA 疫苗和其他治疗产品设计。据悉，这也是百度首次与国际大药厂达成商业协议 。
达成协议后，百度的 LinearDesign 将会整合到赛诺菲的产品设计管线中。该项目负责人、百度美研深度学习实验室主任黄亮博士对路透社表示，当赛诺菲利用百度 LinearDesign 算法发现的 mRNA 候选疫苗或者疗法进入临床试验时，百度将会获得里程碑款项。不过，黄亮并未透露这笔交易的规模。
他还透露，赛诺菲很有信心将使用百度算法开发的候选药物推向临床试验甚至市常
赛诺菲是全球最大的疫苗制造商之一，不过在新冠疫苗开发进程中屡遭挫折。先是自研疫苗研发不顺利，然后是为辉瑞和强生 “代工” 生产新冠疫苗，进展远远落后于辉瑞 / BioNTech 和 Moderna。
今年 8 月，赛诺菲斥资 32 亿美元收购美国 mRNA 公司 Translate Bio，重仓新一代 mRNA 技术。赛诺菲希望通过收购收获 mRNA 技术的红利，打一场 “翻身仗”。9 月，赛诺菲 / Translate Bio 认为新冠疫苗市场趋于饱和，暂停了其 mRNA 新冠疫苗的试验，转而继续与 GSK 合作推进重组蛋白候选新冠疫苗。
不限于新冠疫苗，mRNA 在其他领域同样具有极具前景的治疗潜力。暂停 mRNA 新冠疫苗临床试验时，赛诺菲表示，将会把重点放在针对传染病和其他疾病领域的 mRNA 疫苗和疗法的开发上。与百度的合作，也是赛诺菲强化 mRNA 布局的重要一步。赛诺菲此前启动了 mRNA 流感疫苗的临床 I 期研究，并计划到 2025 年在传染病以及肿瘤治疗领域拥有 6 条进入临床阶段的 mRNA 候选管线。
LinearDesign 是百度研究院于 2020 年 4 月推出的 mRNA 序列优化算法，官方表示适用于包括传染病疫苗、肿瘤控制药物在内的各种 mRNA 药物序列的优化设计。
百度研究院相关负责人曾告诉生辉，LinearDesign 有望成为 mRNA 药物研发的通用算法，并应用于包括传染病疫苗、肿瘤疫苗、单抗药物等各种药物的研发。
LinearDesign 的创新点在于其可以快速有效地对 mRNA 序列稳定性和蛋白质翻译效率进行联合优化。具体来说，LinearDesign 采用了动态规划算法，将衡量 mRNA 序列蛋白质翻译效率的指标、密码子适应指数（CAI），与序列稳定性指标（MFE）进行联合优化，并将这个优化过程所需时间缩短到数分钟之内。
公开资料显示，针对新型冠状病毒 mRNA 疫苗，LinearDesign 能 10 分钟找到并设计出稳定、且蛋白质翻译效率高的 mRNA 分子。在体外和体内试验中已经证明了该算法能够显著提升疫苗序列的稳定性和蛋白质表达水平。
此前，百度与斯微生物达成科研合作，双方从 mRNA 分子稳定性、编码蛋白表达水平以及动物免疫原性三个维度，验证 LinearDesign 算法的有效性。当时的试验数据显示，LinearDesign 设计的 mRNA 分子在结构紧密度、溶液中稳定性、蛋白质表达水平及动物免疫原性均超过用传统方法设计的 mRNA 分子，抗原中和抗体滴度最高超过基准分子的 20 倍，结合抗体指标最高超 23 倍等。
对于此次合作，百度集团副总裁吴甜表示，新兴的 mRNA 技术迅速推进了新冠肺炎等传染疾病的疫苗和药物研发进程，mRNA 与生物计算的结合将使得这一进程更加快速、高效，并可能为未来的药物研发提供了一种全新的思路。
参考资料：
https://www.prnewswire.com/news-releases/baidu-enters-into-license-agreement-with-sanofi-to-enable-next-generation-mrna-therapeutics-and-vaccines-301429737.html
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