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全自动微生物鉴定专家系统的临床应用与评价
来源:互联网   发布日期:2011-09-07 13:57:24   浏览:6610次  

导读: 北京医院检验科(胡去建、许宏涛、张秀珍);湖南医科大学检验系(肖春海) 为了有效控制和治疗传染性疾病,快速和准确获得细菌的药敏结果是非常必要的。近10多年来随着计算机的发展及广泛应用,先后出现了许多自动与半自动细菌鉴定与药敏系统,VITEK系统即...

北京医院检验科(胡去建、许宏涛、张秀珍);湖南医科大学检验系(肖春海)


  为了有效控制和治疗传染性疾病,快速和准确获得细菌的药敏结果是非常必要的。近10多年来随着计算机的发展及广泛应用,先后出现了许多自动与半自动细菌鉴定与药敏系统,VITEK系统即为其中之一。由于药敏结果的可靠性直接关系到临床的治疗效果,但是对体外药敏试验的结果下解释,需要掌握多方面知识:如细菌的耐药机理及对应的表型,细菌的天然耐药性,细菌群体中的最低抑菌浓度(MIC)分布,药物的化学结构及作用方式,体液及组织中药物代谢动力学,体外测试结果与治疗效果的关系等,这些都是由少数专家来完成。于是VITEK系统中设置了专家系统对药敏结果进行审核分析和解释。

一、什么是专家系统

  专家系统是根据抗生素的种类,细菌的种类与目前美国临床实验室标准化委员会(NCCLS)及其他出版的数据信息为药敏结果提供推论性的解释说明。专家系统这一名称也是首次出现在美国微生物学会1999年出版的第7版临床微生物手册中。专家系统自动监测VITEK药敏结果中的异常表型,并对常见耐药表型机制进行评估和推断,即本身是一个提示,出现专家系统即有提示。

二、专家系统的组成

  VITEK专家系统共有144条规则,包括3个等级。

  1.一级专家系统:是对报告中极不可能或从未出现过的表型的警告。例如:药敏结果中出现金黄色葡萄球菌耐万古霉素,则是不可能的表现型。到目前为止未见有报道金黄色葡萄球菌耐万古霉素,要求重复鉴定或药敏试验给予证实,否则系统不予通过。

  2.二级专家系统:是对报告中罕见表型的提示。例如:如果是洋葱伯克霍德菌对氨基糖苷类抗生素和亚胺培南敏感,则是罕见表型,因为洋葱伯克霍德菌对上述两种抗生素天然耐药,也要求重复鉴定或药敏试验给予证实。

  3.三级专家系统:是利用一种耐药表型推断另外一些药物的耐药性或提示药敏结果中的耐药机理。例如:如是肠杆菌对环丙沙星耐药,则对其他喹诺酮抗生素耐药。

三、专定系统的临床应用

  我们通过用VITEK对常规培养分离出来816株细菌进行鉴定和药敏试验,了解其药敏结果出现的专家系统情况,并对结果中出现的一、二级专家系统的解释进行手工纸片扩散布法验证和鉴定试验。

  1.816株细菌经VITEK-IMS60全自动微生物鉴定系统(为生物梅里埃公司产品)的革兰阳性菌鉴定卡(GPI卡)和革兰阴性菌鉴定卡(GNI卡)鉴定结果见表1,这些细菌均为临床上常见的细菌。

  表1  VITEK对816株细菌鉴定结果

GNI卡株数(511)GPI卡株数(305)

绿脓假单胞菌
不动杆菌属
沙雷菌属
大肠埃希菌
克雷伯蓖属
枸橼酸杆菌属
阴沟肠杆菌
产气肠杆菌
变形杆菌
其他细菌83
72
16
95
73
35
51
28
19
39MSSA
MRSA
MSCNS
MRCNS
肠球菌属
无乳链球菌
其他细菌42
30
62
43
74
24
30

合计  816


  注:MSSA:苯唑西林敏感金黄色葡萄球菌;MRSA:耐苯唑西林金黄色葡萄球菌;MSCNS:苯唑西林敏感凝固酶阴性葡萄球菌:MRCNS:耐苯唑西林凝固酶阴性葡萄球菌

  2. 816株细菌根据细菌的种类不同上相应药敏卡,葡萄球菌药敏卡(GPS-SD卡)、链球菌药敏卡(GPS-TA)、大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌药敏卡(GNS-NT)、其他革兰阴性菌药敏卡(GNS-F3和GNS-F5卡),专家系统版本为VTK-R7.01。出现专家系统的情况(如果1株细菌出现2条或2条以上的专家系统,按最高级的1条计算)见表2,共有489株细菌出现专家系统,约占60%。327株细菌无专家系统推荐,表示该试卡显示的耐药表型符合该细菌已知耐药机制的表达,或目前对该细菌耐药表型还未获得可推荐的规则。

  表2  816株细菌出现专家系统的情况

一级专家系统
二级专家系统三级专家系统无专家系统推荐

38
4.7%
(38/816)39
4.8%
(39/816)412
50.5%
(412/816)327
40.0%
(327/816)


  3.对一、二级专家系统所提示的内容用纸片扩散法验证药敏试验所用材料为英国OXOID公司产品;API试纸条为生物梅里埃公司产品,用于重复鉴定,验证结果见表3。

  表3  一、二级专家系统经验证后的情况

专家系统出现的次数符合专家系统的次数(%)不符合专家系统的次数(%)

一级
二级38
3928(74)
32(82)10(26)
7(18)

合计7760(78)17(22)

  在一级专家系统中,28次经验证后符合专家系统,出现的原因是多种多样,分布于操作(金黄色葡萄球菌耐万古霉素和无乳链球菌耐青霉素的原因为菌落不纯)、人为的判断(屎肠球菌、鹑鸡肠球菌和铅黄肠球菌的试卡上的生化反应非常接近,只有通过30°是否有动力和菌落是否有黄色色素才能区分,如果只从概率高低把铅黄肠球菌输入一个对万古霉素敏感的药敏卡,就会获得一级专家系统,为铅黄肠球菌天然耐万古霉素)和仪器因素(大肠埃希菌对一代喹诺酮抗生素萘啶酸敏感,而对二代三喹诺酮抗生素或环丙沙星结果耐药,纸片扩散法验证药敏试验发现在萘啶酸纸片的周围有耐药菌株)等多方面。10次不符合专家系统的细菌为鲍曼不动杆菌和绿逐假单胞菌对试卡(GNS-F3)中全部抗生素耐药,经验证为全部耐药。

  在二级专家系统中,经验证后8

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