鼠疫的爆发，与环境卫生有很大关系，以大明京师为例。明初明中时，大明政财相对宽裕，对京城内沟渠卫生的管理较为得当，人称京师街巷最洁最阔，不过从万历后期起，京师沟渠尽被阻塞，却是无钱淘浚治理，运道也无财修补，到了崇祯年间，北京城的街道环境更是糟糕，晴天尘土飞扬，雨天泥泞难行，街道旁的沟渠，尽成藏污纳垢之地，秽气触人。