大明的国力有限、边防开支只能靠漕运千里迢迢运送而来，为了巩固九边，保护北京，大明不得不将北防系统退缩内守。先是废撤了西线——由哈密卫撤退到嘉峪关，再缩到河套，以后又放弃河套，退守到晋北。给蒙古各部的死灰复燃创造了机会。而后又在东北大踏步后退——从鸭绿江畔一直退到松花江以南，继而放弃了能同时威慑蒙、满的开平卫，向南退守至居庸关至山海关一线。给女真的兴起留下了空间。