整合兵部、肃清军纪，操练户部吏员、开始编户齐民的同时，对于工部的改革也在大刀阔斧的进行。在工部上层，提拔了数名思维活跃的匠人担任主官，对于当初跟随在江宁格物研究院中的工匠，但凡有大贡献的，君武都对其进行了擢升，甚至对其中两人赐予爵位，并且公开许诺，只要将来能在格物学发展上有大建树者，绝不会吝于封官赐爵。