负责行政的行政部，负责传教的传教部，负责审查异端的审查部，负责军事方面的防卫部，以及张无悔亲自掌握的负责刺探情报的刺探部，五大部门，将新生的神明教的骨架子给架了起来，神明教日趋完善，对于外界的抵抗力也更加强大，逐步收复了原先的失地，将那些佛派和道派的暴力组织占据的地方一一收回，同时吸收饱受凄苦的人进入军队里面，他们会成为反抗佛道的急先锋。